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郝海平/葉慧團隊在Nat Chem Biol發表癌細胞中糖酵解靶標圖譜

 近日,Nature Chemical Biology在線發表了我校郝海平/葉慧團隊最新研究成果:Chemoproteomic mapping of the glycolytic targetome in cancer cells。中國藥科大學田揚博士、皖寧博士、邵暢博士及張漢卿博士研究生為本文共同第一作者,郝海平教授和葉慧研究員為本文共同通訊作者。合作作者還包括我校王廣基院士生命科學與技術學院丁明研究員、胡海洋副研究員藥學院孫慧涌副研究員,南京大學陳帥教授團隊以及我校研究生鮑秋雨、劉宸光等。研究還獲得了藥學院肖易倍教授、藥物科學研究院江煒老師的協助和支持。

研究聚焦于大多數癌細胞中過度活躍的糖酵解通路。基于前期多個重磅研究揭示出糖酵解通路上部分代謝物可以作為信號分子發揮非代謝的功能,研究團隊提出通過描繪糖酵解通路上主要代謝物的靶標組,全面理解糖酵解支撐腫瘤發生發展的機制。為了高通量描繪多個代謝物的靶標,郝海平/葉慧團隊在現有靶標發現技術體系中尋求創新,建立了靶標響應可及性變化譜TRAP技術(Target-Responsive Accessibility Profiling)。TRAP通過標記全蛋白組水平賴氨酸來表征蛋白的溶劑可及性,再通過比較配體結合前后蛋白可及性的變化,鑒定靶標及配體結合區域;具有互補于現有靶標發現方法的技術優勢。

利用TRAP技術,團隊在模型癌細胞系中共描繪了10種糖酵解代謝物的靶標組,共發現913個可及性變化的候選靶標。進一步的機制研究揭示了糖酵解代謝物對靶標組的豐富調控模式,包含干擾碳代謝酶的活性、影響轉錄蛋白的功能及靶標的翻譯后修飾水平等(見示意圖)。上述結果確證了癌細胞中糖酵解代謝物除了參與代謝層面的活動以外,還作為信號分子發揮全局調控功能,為后續基于糖酵解代謝物的靶標組挖掘癌癥治療靶點提供了重要的線索與數據資源。

本項目依托國家自然科學基金項目(81930109和82173783)、江蘇省自然科學基金項目(BK20220088)、國家重點研發計劃項目(2021YFA1301300)等。感謝多靶標天然藥物全國重點實驗室及江蘇省藥代動力學重點實驗室平臺的大力支持。

論文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41589-023-01355-w

示意圖

新聞封面圖

(供稿單位:藥學院,撰寫人:劉華,審稿人:黃欣)




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