近日,生命科學學科頂尖期刊Nucleic Acids Research(IF=16.6)在線發表了我校生命科學與技術學院鄭珩課題組的最新研究成果:DRAMP 4.0: an open-access data repository dedicated to the clinical translation of antimicrobial peptides。我校碩士研究生馬天玥為論文第一作者,鄭珩副教授及勞興珍副教授為本文的共同通訊作者,中國藥科大學為本文的唯一通訊單位。
細菌耐藥性是當前全球公共衛生領域面臨的重要問題之一。抗菌肽具有廣譜抗菌活性,作用機制獨特,較難誘導耐藥,在耐藥細菌感染臨床上具有重要應用前景,但受限于穩定性、溶血性以及細胞毒性等性質,目前進入臨床研究的抗菌肽仍較少。DRAMP(Data repository of antimicrobial peptides, http://dramp.cpu-bioinfor.org/)第4版更新側重于抗菌肽的臨床轉化,首次添加了抗菌肽血清/蛋白酶半衰期穩定性數據,并補充了大量實驗測定的抗菌肽溶血/細胞毒性數據。除此以外,本次更新新增了8000多條抗菌肽條目,包括來自中文文獻的抗菌肽信息。這些信息和數據可以免費從數據庫的download界面下載,可用于促進人工智能輔助的抗菌藥物設計。
該工作受到863項目、重大新藥專項、國家自然科學基金面上項目和江蘇高校優勢學科建設工程項目等資助。我校徐寒梅教授對本數據庫的立項和建設給予了重大支持和幫助,碩士研究生孫健、范琳琳、康馨月和施國邦等參與前三版數據庫的建設和更新工作。
文章鏈接:https://doi.org/10.1093/nar/gkae1046
(供稿單位:生命科學與技術學院,撰寫人:姚嘉儀,審稿人:劉帆)